如何使用跨 r 列的 t 检验循环中的 p 值创建数据框？

Question

我有两个值矩阵，代表两个队列，横跨 166 列，代表天数（例如 Day1）。

condition_1

        Day1 Day2 Day3 ... Day166
person1 27   38   94       40
person2 69   16   85       47
person3 99   30   90       50
person4 69   88   35       4

和

condition_2

        Day1 Day2 Day3 ... Day166
person1 55   34   17       33
person2 39   77   21       86
person3 98   30   13       71
person4 61   15   29       98

我想循环成对的 t.test()，它比较每个条件下相应日期的均值，并按天创建一个具有 p 值的新向量，如下所示：

     p-value
Day1 0.5
Day2 0.7
Day3 0.88
Day4 0.001

Answer 1

你可以试试这个：

data.frame(
  "p-value" = sapply(1:166, \(x) t.test(condition_1[,x],condition_2[,x], paired=T)$p.value),
  row.names = paste0("Day",1:166)
)

（注意：如果您使用 R<4.1，请使用 function(x) 而不是 \(x)）

输出：（前六行）

          p.value
Day1   0.60042478
Day2   0.05388822
Day3   0.81511287
Day4   0.16105380
Day5   0.89930687
Day6   0.89607922

如何使用跨 r 列的 t 检验循环中的 p 值创建数据框？

How to create dataframe with p-values from a t-test loop across columns in r?

r

apply

p-value

t-test