为 Snakemake DAG 中的每条规则指定颜色
Specify a color for each rule in Snakemake DAG
我 运行 snakemake -n -c1 --dag | dot -Tsvg > dag.svg
来获取 DAG 文件。
我想知道我是否可以以某种方式为每个节点设置配色方案。例如,在下图中,规则 samtools_fixmate
与 samtools_sort
和 samtools_markduplicates
的颜色不同。你能以某种方式在 snakemake 文件中指定节点应该是什么颜色吗?
即使是 out-of-snakefile 解决方案,我也会接受。
类似于,您可以将dag导出为点文件:
snakemake --dag > test.dot
然后可以根据需要编辑点文件。
我 运行 snakemake -n -c1 --dag | dot -Tsvg > dag.svg
来获取 DAG 文件。
我想知道我是否可以以某种方式为每个节点设置配色方案。例如,在下图中,规则 samtools_fixmate
与 samtools_sort
和 samtools_markduplicates
的颜色不同。你能以某种方式在 snakemake 文件中指定节点应该是什么颜色吗?
即使是 out-of-snakefile 解决方案,我也会接受。
类似于
snakemake --dag > test.dot
然后可以根据需要编辑点文件。