导入失败 scipy.special "Symbol not found: ___addtf3"

Question

每当我尝试运行此代码时：

from scipy.special import legendre

我一直遇到以下错误。

ImportError: 

dlopen(/Users/william/miniconda/envs/myenv/lib/python3.4/site-packages/scipy/special/_ufuncs.so, 2): Symbol not found: ___addtf3
  Referenced from: /Users/william/miniconda/envs/prakenv/lib/python3.4/site-packages/scipy/special/_ufuncs.so
  Expected in: /usr/lib/libSystem.B.dylib

我已经尝试恢复到以前版本的 scipy 并使用 Python 2.7 conda 环境，但问题仍然存在。我以前用 scipy 从来没有遇到过这个问题。非常感谢！

Answer 1

我有一个临时修复方法（还原 scipy），但我更愿意确定问题的确切原因：

conda uninstall scipy
conda install scipy=0.15.0

这是在 Yosemite 运行 Python 3.4 miniconda 环境中。

Answer 2

conda v 3.15.0 显然有问题导致了这些症状。修复是在 2015 年 7 月 23 日发布 conda v 3.15.1，并让人们重新安装。

参见 conda issue #1467, Error in scipy 0.16 packaging in official conda channels on OSX 上的讨论。考虑到你提问的时间，就在几天后的 2015 年 7 月，这可能对你有影响。

Answer 3

我遇到了类似的问题，只是我使用 pip install -r requirements.txt 在 virtualenv 中安装 scipy，其中一个要求是 scipy==0.18.0。我终于通过删除我的 pip 缓存并重试解决了这个问题。

更具体地说，我是这样做的：

停用 virtualenv flask
sudo rm -r flask/
仔细检查了我的 PATH 和 PYTHONPATH 环境变量，去掉了对其他项目和其他 Python 版本的引用
将我的 MacPorts Python 版本设置为 2.7，符合我项目的需要：Sudo port set python python27
删除我的 pip 缓存，rm -r ~/Library/Caches/pip/http/* ~/Library/Caches/pip/wheels/*
重新创建了 virtualenv：virtualenv flask
重新激活虚拟环境：source flask/bin/activate
执行了 make 操作，调用了 pip install -r requirements.txt

我想出了一个 shorthand 来检测问题：

% python -c 'import scipy.special'

当问题发生时，我收到错误响应：

Traceback (most recent call last):
  File "<string>", line 1, in <module>
  File "/Users/myuser/project/flask/lib/python2.7/site-packages/scipy/special/__init__.py", line 636, in <module>
    from ._ufuncs import *
ImportError: dlopen(/Users/myuser/project/flask/lib/python2.7/site-packages/scipy/special/_ufuncs.so, 2): Symbol not found: ___addtf3
  Referenced from: /Users/myuser/project/flask/lib/python2.7/site-packages/scipy/special/../.dylibs/libquadmath.0.dylib
  Expected in: /usr/lib/libSystem.B.dylib
 in /Users/myuser/project/flask/lib/python2.7/site-packages/scipy/special/../.dylibs/libquadmath.0.dylib

问题改正后，没有输出。

在没有scipy的环境中（例如在virtualenv之外）测试运行时，出现了预期的错误：

ImportError: No module named scipy.special

导入失败 scipy.special "Symbol not found: ___addtf3"

Failed scipy.special import "Symbol not found: ___addtf3"

python

scipy