脚本不适用于高性能计算机

Question

我正在使用 Tinaroo（昆士兰大学的高性能计算机）

我构建了一个演示 python 代码 (demo1.py)，很简单，它创建了一个包含代码执行时间的文件。

import datetime

StartTime = datetime.datetime.now().strftime("%Y%m%d%H%M%S")
print("Start : " + StartTime)
out = "Hello This working at " + StartTime
text_file = open("Result_"  + "_" + StartTime , "w")
n = text_file.write(out)
text_file.close()

我测试过，工作正常

现在我想将它作为 PBS JOB 发送到服务器。

我构建了这个 PBS 文件 (simpledemo.pbs)

#!/bin/bash
#PBS -j oe
#PBS -m ae
#PBS -N SimpleDemo
#PBS -o out.log
#PBS -e out.log
#PBS -l walltime=01:00:00
#PBS -l select=1:ncpus=1:mem=4GB

shopt -s expand_aliases
source /etc/profile.d/modules.sh
cd ${PBS_O_WORKDIR}
module load python3
python3 demo1.py

但它不执行 python 代码，我得到这个 out.log 文件

########################### Execution Started #############################
JobId:731935.tinmgr2
UserName:asmgx
GroupName:qj
ExecutionHost:tn327a
###############################################################################
/var/spool/pbs/mom_priv/jobs/731935.tinmgr2.SC: line 14: python3: command not found
########################### Job Execution History #############################
JobId:731935.tinmgr2
UserName:asmgx
GroupName:qj
JobName:SimpleDemo
SessionId:27100
ResourcesRequested:mem=4gb,ncpus=1,place=free,walltime=01:00:00
ResourcesUsed:cpupercent=100,cput=00:00:05,mem=0kb,ncpus=1,vmem=0kb,walltime=00:00:05
QueueUsed:General
AccountString:qj
ExitStatus:127
###############################################################################

显然出现了这个错误：

python3: command not found

有人知道如何解决这个问题吗？

Answer 1

消息错误显示在此脚本中：/var/spool/pbs/mom_priv/jobs/731935.tinmgr2.SC，找不到命令 python3。您可以将其修改为 python，或者创建一个真正的可执行文件 python 的软链接并将其命名为 python3（并将其添加到您的 PATH 环境变量）。

脚本不适用于高性能计算机

Script is not working with high performance computer

python

linux

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pbs

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