在 R 中，如何检查卸载包中是否存在函数？

Question

我可以检查我的环境中是否存在函数：

> exists("is.zoo")
[1] FALSE

我可以通过加载包来检查函数是否存在：

> library(zoo)
> exists("is.zoo")
[1] TRUE

但是如何在 不加载 包的情况下检查包中是否存在函数？

> exists("zoo::is.zoo")
[1] FALSE

Answer 1

这不是一个很好的答案，它可能有一些缺陷，但它是一个开始。

is_exported <- function(fn, pkg){
  nmsp <- readLines(system.file("NAMESPACE", package = pkg))
  nmsp <- paste0(nmsp, collapse = " ")

  Exports <- stringr::str_extract_all(nmsp,
                                   stringr::regex("(?<=export[(]).+?(?=[)])"))
  Methods <- stringr::str_extract_all(nmsp,
                                   stringr::regex("(?<=S3method[(]).+?(?=[)])"))

  any(grepl(stringr::regex(fn), c(Exports, Methods)))
}

is_exported("is.zoo", "zoo")

Answer 2

即使函数未加载，您也可以查看其源代码。

> exists("zoo::is.zoo")
[1] FALSE
> zoo::is.zoo
function (object)
inherits(object, "zoo")
<environment: namespace:zoo>

所以你可以用这样的函数来利用它

exists_unloaded <- function(fn) {
  tryCatch( {
    fn
    TRUE
  }, error=function(e) FALSE
  )
}

如果对 fn 的调用出错，它将 return FALSE；如果 fn 显示来源，TRUE 将被 returned。

> exists("zoo::is.zoo")
[1] FALSE
> exists_unloaded(zoo::is.zoo)
[1] TRUE
> exists_unloaded(zoo::is.zootoo)
[1] FALSE

（注意，所有字符串都写成 exists_unloaded returns TRUE。如果 fn 是字符串，可能会出错。）

编辑：

此外，您可以在不加载包的情况下调用函数。我不知道你的完整用例，但它可能会避免检查它是否存在的需要。（当然，如果用户没有安装包，还是会失败。）

> exists("zoo::is.zoo")
[1] FALSE
> zoo::is.zoo(1)
> z <- zoo::as.zoo(1)
> zoo::is.zoo(z)
[1] TRUE

Answer 3

如果您不想使搜索路径混乱，使用 loadNamespace 可以与 getAnywhere

结合使用

请注意，这将查找未导出或导出的函数...

loadNamespace('zoo')
x <- getAnywhere('is.zoo')
x[['where']]=='namespace:zoo'
# TRUE

将其包装在一个函数中

exist_pkg <- function(f, pkg){
  loadNamespace(pkg)
  x <- getAnywhere(f)
  paste0('namespace:',pkg) %in% x[['where']]
}

如果你真的想要的话，之后你可以小心地卸载命名空间

您也可以使用 getFromNamespace

is.function(getFromNamespace("is.zoo", "zoo"))
# TRUE

Answer 4

您可以使用 exists 函数查看命名空间内部：

exists2 <- function(x) {

    assertthat::assert_that(assertthat::is.string(x))

    split <- base::strsplit(x, "::")[[1]]

    if (length(split) == 1) {
        base::exists(split[1])
    } else if (length(split) == 2) {
        base::exists(split[2], envir = base::asNamespace(split[1]))
    } else {
        stop(paste0("exists2 cannot handle ", x))
    }
}

Answer 5

好的，这需要更准确的答案。

简短版本：你不能。

要了解原因，请考虑包中的以下代码：

eval(parse(text = paste0("foo <- func", "tion () 1 + 1")))

这将创建一个函数 foo。但是您只能通过运行 R 代码了解这一点。

您可以检查 export(foo) 的 NAMESPACE 文件，但不幸的是，作者可能写了类似 exportPattern("f.*") 的内容，因此也不可靠。

长版：免不了加载包，但可以免附加。换句话说，R 将解释包源文件（并加载任何 dll），并将包存储在内存中，但它不会直接在搜索路径上可用。

ns <- loadNamespace(package)
exists("foo", ns)

然后您可以使用 unloadNamespace(package) 卸载命名空间。但请参阅 ?detach 中的警告：这并不总是保证有效！ loadNamespace(package, partial = TRUE) 可能有帮助，或者 devtools::load_all 和 devtools::unload 可能会做一些更聪明的事情，我不知道。

一些答案建议 try{package::foo} 之类的内容。问题是这本身加载了命名空间：

> isNamespaceLoaded("broom")
[1] FALSE
> try(broom::tidy)
function(x, ...) UseMethod("tidy")
<environment: namespace:broom>
> isNamespaceLoaded("broom")
[1] TRUE

在 R 中，如何检查卸载包中是否存在函数？

In R, how can I check for the existence of a function in an unloaded package?

r

exists

package