为什么在创建 bean plot 时出现 density.default 错误

Question

我正在尝试创建一个 beanplot：

library(beanplot)

beanplot(df, col="#cccccc", log="y", names="plot-1", yaxt="n", overallline="median", ll=0.00001)

但是，我收到以下错误：

Error in density.default(mlog(x), bw = bw, kernel = kernel, from = from,  : 
  non-finite 'from'

有人可以帮忙吗？

Answer 1

如果没有看到您的数据就无法确定，但我怀疑您的问题来自于输入中有一个或多个零，然后试图在对数刻度上绘制它的密度。

我可以像这样重现你的问题：

library(beanplot)

df <- data.frame(x = 0:10)

beanplot(df, col="#cccccc", log = 'y', names="plot-1", 
         overallline="median", ll=0.00001)
#> Error in density.default(mlog(x), bw = bw, kernel = kernel, from = from,  : 
#>   non-finite 'from'

如果我们删除零，我们会得到一个图：

beanplot(df[df$x != 0,], col="#cccccc", log = 'y', names="plot-1", 
         overallline="median", ll=0.00001)

或者我们可以删除对数刻度并保留零：

beanplot(df, col="#cccccc", names="plot-1", overallline="median", ll=0.00001)

但显然我们不能同时保持零和具有对数刻度，因为零的对数在 R 中被解释为负无穷大。

为什么在创建 bean plot 时出现 density.default 错误

why do I get Error in density.default while creating bean plot

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beanplot