heredoc 和 PBS 的数组索引问题

Question

我正在编写一个脚本，该脚本生成由 PBS 调度系统运行的批处理作业，使用 heredoc 创建作业实例。问题是，批处理脚本中的数组不能被变量索引。它总是 returns 数组的第一个元素。相比之下，按整数索引数组会按预期工作。

#!/bin/bash

export MY_ARRAY=(a b c)
export MY_ARRAY_LENGTH=${#MY_ARRAY[@]}

qsub -V -lselect=1:ncpus=1:mem=8gb -lwalltime=00:01:00 -N test -J 1-${MY_ARRAY_LENGTH} <<EOF

echo "PBS array index: $PBS_ARRAY_INDEX"

I=$((${PBS_ARRAY_INDEX} - 1))
echo "MY_ARRAY index: $I" 

## this works as expected, returning the second element of the array
echo "element selected by integer: ${MY_ARRAY[1]}"

## this does not work as expected, returning the first element of
## MY_ARRAY regardles of $I 
echo "element selected by variable: ${MY_ARRAY[$I]}"

EOF

数组作业 3 的输出，即第 3 个元素是：

PBS array index: 3
MY_ARRAY index: 2
element selected by integer: b
element selected by variable: a

在上面的例子中，表达式 ${MY_ARRAY[$I]} 应该给我值“c”。为什么这不起作用？

注意我明白转义符号\是变量所必需的不被调用脚本评估，但这似乎并不所有变量都是这种情况。这是为什么？

Answer 1

编写此类脚本非常困难，double-escaping 令人困惑。考虑一个不同的方法，它只是将上下文发送到远程端 包括要执行的代码 然后执行代码。这样代码就简单了。记得用 shellcheck 检查你的脚本。

#!/bin/bash

MY_ARRAY=(a b c)
work() {
    # normal script
    echo "PBS array index: $PBS_ARRAY_INDEX"
    
    I=$((${PBS_ARRAY_INDEX} - 1))
    echo "MY_ARRAY index: $I" 
    
    ## this works as expected, returning the second element of the array
    echo "element selected by integer: ${MY_ARRAY[1]}"
    
    ## this does not work as expected, returning the first element of
    ## MY_ARRAY regardles of $I 
    echo "element selected by variable: ${MY_ARRAY[$I]}"

}

qsub -V -lselect=1:ncpus=1:mem=8gb -lwalltime=00:01:00 -N test -J 1-${MY_ARRAY_LENGTH} <<EOF
$(declare -p MY_ARRAY)  # serialize variables
$(declare -f work)      # serialize function
work                    # excute the function
EOF

## this does not work as expected, returning the first element of
## MY_ARRAY regardles of $I

是，I= 在 远程端 设置，而 ${MY_ARRAY[$I]} 在 客户端 扩展.客户端没有设置I，所以$I为空，空转为0，成为第一个元素

heredoc 和 PBS 的数组索引问题

Array indexing problems with heredoc and PBS

bash

heredoc

qsub

pbs