在 Ubuntu 和 Mac 上安装 rgl:找不到 X11

Installing rgl on Ubuntu and Mac: X11 not found

我在这里看到这个问题:Error in loading rgl package with Mac OS X 但是没有提到安装错误,这是我的情况。我无法安装 rgl 包,在 R:

中使用此命令
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("rgl")

显示以下错误:

configure: error: X11 not found but required, configure aborted. ERROR: configuration failed for package ‘rgl’ * removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/rgl’

我查看了这个地址/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library,没有rgl文件夹,所以无法删除aglrgl.so(或rgl.so),这就是上面的答案-提到的问题。你能帮我解决这个安装问题吗?谢谢。

不确定 Mac 的情况,但在 Windows 我在下载相同的 rgl 包时遇到了问题。安装 RGL 需要 devtools 包

install.packages("devtools")
library(devtools)
install.packages("rgl")
library(rgl)

在 Ubuntu,对我有用的是直接从命令行安装包:

sudo apt-get install r-cran-rgl

(我们这里有一个奇怪的设置,所以 YMMV)

在 CentOS 上,最终成功的方法是安装 libpng-dev:

sudo yum install libpng-devel.x86_64

在此之前,我安装了 xorg、libx11、mesa GL 库和 freeglut。

sudo yum install xorg-x11-server-Xvfb.x86_64 xorg-x11-server-devel.x86_64 
sudo yum install libX11.x86_64 libX11-devel.x86_64
sudo yum install mesa-libGL mesa-libGL-devel mesa-libGLU mesa-libGLU-devel
sudo yum install freeglut.x86_64 freeglut-devel.x86_64

我最终弄清楚缺少什么的方法是尝试从源代码编译(在 cran 下载 tar.gz),并在 ./configure 失败后检查 config.log。

在 Ubuntu 16.04 和 18.04 上,您在尝试从 CRAN 安装 rgl 时可能会遇到此问题:

checking for X... no configure: error: X11 not found but required, configure aborted.

ERROR: configuration failed for package ‘rgl’

感谢这个博客,它解决了我在安装时遇到的问题 rgl:

http://solaimurugan.blogspot.ca/2015/09/3d-data-visualization-using-r-configure.html

万一上面的 link 消失了,博客中概述的解决方案是:

sudo apt-get install xorg 
sudo apt-get install libx11-dev 
sudo apt-get install libglu1-mesa-dev 

最近,在全新 ubuntu 16.04 安装上安装 rgl 还需要进一步的步骤(如以下评论中所述),如果出现此错误:

fatal error: ft2build.h: No such file or directory

解决方法是:

sudo apt-get install libfreetype6-dev

然后从 CRAN 安装 rgl 应该就可以了。

所有提到的答案都是正确的;但是,none 用于 Mac。

就我而言(我是 Mac 用户),我通过安装 XQuartz 并重新启动 R 解决了问题。

在 OpenSuse 上

sudo zypper install xorg-x11-devel
sudo zypper install glu-devel

我花了很长时间才在 [RHEL 3.10.0-862.14.4.el7.x86_64 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux]。需要以下软件包:

libpng12-devel.x86_64
ImageMagick-c++-devel.x86_64
mesa-libGLU-devel.x86_64
libselinux-devel.x86_64
xorg-x11-apps