在 Ubuntu 和 Mac 上安装 rgl:找不到 X11
Installing rgl on Ubuntu and Mac: X11 not found
我在这里看到这个问题:Error in loading rgl package with Mac OS X 但是没有提到安装错误,这是我的情况。我无法安装 rgl
包,在 R
:
中使用此命令
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("rgl")
显示以下错误:
configure: error: X11 not found but required, configure aborted.
ERROR: configuration failed for package ‘rgl’
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/rgl’
我查看了这个地址/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library
,没有rgl
文件夹,所以无法删除aglrgl.so
(或rgl.so
),这就是上面的答案-提到的问题。你能帮我解决这个安装问题吗?谢谢。
不确定 Mac 的情况,但在 Windows 我在下载相同的 rgl 包时遇到了问题。安装 RGL 需要 devtools 包
install.packages("devtools")
library(devtools)
install.packages("rgl")
library(rgl)
在 Ubuntu,对我有用的是直接从命令行安装包:
sudo apt-get install r-cran-rgl
(我们这里有一个奇怪的设置,所以 YMMV)
在 CentOS 上,最终成功的方法是安装 libpng-dev:
sudo yum install libpng-devel.x86_64
在此之前,我安装了 xorg、libx11、mesa GL 库和 freeglut。
sudo yum install xorg-x11-server-Xvfb.x86_64 xorg-x11-server-devel.x86_64
sudo yum install libX11.x86_64 libX11-devel.x86_64
sudo yum install mesa-libGL mesa-libGL-devel mesa-libGLU mesa-libGLU-devel
sudo yum install freeglut.x86_64 freeglut-devel.x86_64
我最终弄清楚缺少什么的方法是尝试从源代码编译(在 cran 下载 tar.gz),并在 ./configure 失败后检查 config.log。
在 Ubuntu 16.04 和 18.04 上,您在尝试从 CRAN 安装 rgl
时可能会遇到此问题:
checking for X... no configure: error: X11 not found but required, configure aborted.
ERROR: configuration failed for package ‘rgl’
感谢这个博客,它解决了我在安装时遇到的问题 rgl
:
http://solaimurugan.blogspot.ca/2015/09/3d-data-visualization-using-r-configure.html
万一上面的 link 消失了,博客中概述的解决方案是:
sudo apt-get install xorg
sudo apt-get install libx11-dev
sudo apt-get install libglu1-mesa-dev
最近,在全新 ubuntu 16.04 安装上安装 rgl 还需要进一步的步骤(如以下评论中所述),如果出现此错误:
fatal error: ft2build.h: No such file or directory
解决方法是:
sudo apt-get install libfreetype6-dev
然后从 CRAN 安装 rgl
应该就可以了。
所有提到的答案都是正确的;但是,none 用于 Mac。
就我而言(我是 Mac 用户),我通过安装 XQuartz 并重新启动 R 解决了问题。
在 OpenSuse 上
sudo zypper install xorg-x11-devel
sudo zypper install glu-devel
我花了很长时间才在 [RHEL 3.10.0-862.14.4.el7.x86_64 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux]。需要以下软件包:
libpng12-devel.x86_64
ImageMagick-c++-devel.x86_64
mesa-libGLU-devel.x86_64
libselinux-devel.x86_64
xorg-x11-apps
我在这里看到这个问题:Error in loading rgl package with Mac OS X 但是没有提到安装错误,这是我的情况。我无法安装 rgl
包,在 R
:
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("rgl")
显示以下错误:
configure: error: X11 not found but required, configure aborted. ERROR: configuration failed for package ‘rgl’ * removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/rgl’
我查看了这个地址/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library
,没有rgl
文件夹,所以无法删除aglrgl.so
(或rgl.so
),这就是上面的答案-提到的问题。你能帮我解决这个安装问题吗?谢谢。
不确定 Mac 的情况,但在 Windows 我在下载相同的 rgl 包时遇到了问题。安装 RGL 需要 devtools 包
install.packages("devtools")
library(devtools)
install.packages("rgl")
library(rgl)
在 Ubuntu,对我有用的是直接从命令行安装包:
sudo apt-get install r-cran-rgl
(我们这里有一个奇怪的设置,所以 YMMV)
在 CentOS 上,最终成功的方法是安装 libpng-dev:
sudo yum install libpng-devel.x86_64
在此之前,我安装了 xorg、libx11、mesa GL 库和 freeglut。
sudo yum install xorg-x11-server-Xvfb.x86_64 xorg-x11-server-devel.x86_64
sudo yum install libX11.x86_64 libX11-devel.x86_64
sudo yum install mesa-libGL mesa-libGL-devel mesa-libGLU mesa-libGLU-devel
sudo yum install freeglut.x86_64 freeglut-devel.x86_64
我最终弄清楚缺少什么的方法是尝试从源代码编译(在 cran 下载 tar.gz),并在 ./configure 失败后检查 config.log。
在 Ubuntu 16.04 和 18.04 上,您在尝试从 CRAN 安装 rgl
时可能会遇到此问题:
checking for X... no configure: error: X11 not found but required, configure aborted.
ERROR: configuration failed for package ‘rgl’
感谢这个博客,它解决了我在安装时遇到的问题 rgl
:
http://solaimurugan.blogspot.ca/2015/09/3d-data-visualization-using-r-configure.html
万一上面的 link 消失了,博客中概述的解决方案是:
sudo apt-get install xorg
sudo apt-get install libx11-dev
sudo apt-get install libglu1-mesa-dev
最近,在全新 ubuntu 16.04 安装上安装 rgl 还需要进一步的步骤(如以下评论中所述),如果出现此错误:
fatal error: ft2build.h: No such file or directory
解决方法是:
sudo apt-get install libfreetype6-dev
然后从 CRAN 安装 rgl
应该就可以了。
所有提到的答案都是正确的;但是,none 用于 Mac。
就我而言(我是 Mac 用户),我通过安装 XQuartz 并重新启动 R 解决了问题。
在 OpenSuse 上
sudo zypper install xorg-x11-devel
sudo zypper install glu-devel
我花了很长时间才在 [RHEL 3.10.0-862.14.4.el7.x86_64 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux]。需要以下软件包:
libpng12-devel.x86_64
ImageMagick-c++-devel.x86_64
mesa-libGLU-devel.x86_64
libselinux-devel.x86_64
xorg-x11-apps