在 pip 包构建上编译 Cython

Question

我正在开发一个 Python 包，EcoPy，它主要是用纯 Python 编写的。主文件夹称为 ecopy。有一个名为 regression 的子文件夹，其中包含一个已经构建的 Cython 文件。主 setup.py 文件包含代码：

ext_modules = cythonize([
    Extension(
        'ecopy.regression.isoFunc', ['ecopy/regression/isoFunc.pyx'], **opts),
])

当我运行

sudo pip install ecopy -e . --upgrade --force-reinstall

模块构建良好。如果我删除了 isoFunc.c 文件，它甚至会重新编译它。问题是 Cython 然后没有将 .c 文件转换为 .so 文件，我需要它来导入函数。如果我尝试在没有它的情况下加载模块，我会得到

ImportError: No module named isoFunc

如果我使用命令行手动设置文件

python setup.py build_ext --inplace

Cython 会生成 .so 文件。如何使用 pip 生成 .so 文件？我试图通过阅读他们的代码来弄清楚 statsmodels 是如何做到的，但老实说，这对我来说是个谜。

就好像 pip 命令遗漏了 build_ext 参数。

Answer 1

我可以回答这个问题，因为我才知道我是个白痴。

sudo pip install ecopy -e . --upgrade --force-reinstall

正在使用 PyPI 的旧版本，该版本没有新的 setup.py 和 Cython 代码。当我做对时

sudo pip install -e . --upgrade --force-reinstall

并在我的硬盘上使用了最新版本，它运行良好。

小小的胜利。

Answer 2

我来这里是因为我不确定 pip 安装我的包是否足以自动编译 Cython 源代码。看起来确实如此，但默认情况下 pip 输出似乎没有记录。我注意到 pip install -e . -v 非常清楚编译和 link 步骤是否/具体做了什么：

Running setup.py develop for mypackage
  [...]
  running build_ext
  cythoning mypackage/my_cython_module.pyx to mypackage/my_cython_module.c
  building 'mypackage.my_cython_module' extension
  x86_64-linux-gnu-gcc [...] -c mypackage/my_cython_module.c -o build/temp.linux-x86_64-2.7/mypackage/my_cython_module.o
  x86_64-linux-gnu-gcc [...] build/temp.linux-x86_64-2.7/mypackage/my_cython_module.o -o build/lib.linux-x86_64-2.7/mypackage/my_cython_module.so
  copying build/lib.linux-x86_64-2.7/mypackage/my_cython_module.so -> mypackage
  [...]

在 pip 包构建上编译 Cython

Compile Cython on pip package build

python

pip

cython