Rscript 是否更改 LD_LIBRARY_PATH？
Does Rscript change LD_LIBRARY_PATH?
我正在 运行ning 一个 R 版本（不是用 intel parallel studio 编译的），我正在尝试加载我自己编译的 intel 编译共享 Fortran 库.在我用于 运行 的脚本中，我包含了 LD_LIBRARY_PATH，然后使用 Rscript 来 运行 R 脚本（调用 dyn.load("My_Fortran.so") , 使用 ifort 和 mkl 编译)。
然而，当我 运行 脚本时，它失败并显示 Intel MKL FATAL ERROR: Cannot load libmkl_avx.so or libmkl_def.so。 Rscript 是否有可能撤消我对 LD_LIBRARY_PATH 的设置？如果不是，是否可能因为这个版本的 R 不是用 intel parallel studio 编译的，所以它无法加载共享库？
我是这样 运行R 脚本并加载路径的：
#!/bin/bash
module load R/3.1.0
LD_LIBRARY_PATH=/path/to/intel_parallel_studio/xe_2015_u3/install/mkl/lib/intel64:$LD_LIBRARY_PATH
export LD_LIBRARY_PATH
Rscript myRscript.r
R 脚本失败：
Running R code
Attempting to load Fortran compiled shared library ... Done!
Calling Fortran subroutine from within R ...
MKL FATAL ERROR: Cannot load libmkl_avx.so or libmkl_def.so
您可以查看 R 和 Rscript 的 shell 脚本源代码。
一般来说，此类 PATH 设置（用于可执行文件和共享库）通常只会添加到，而不会被覆盖。所以你可能有另一个问题。
你可以编辑 /etc/ld.so.conf 吗？
编辑 还可以考虑在 module load R/3.1.0.
之前 设置 LD_LIBRARY_PATH
我正在 运行ning 一个 R 版本（不是用 intel parallel studio 编译的），我正在尝试加载我自己编译的 intel 编译共享 Fortran 库.在我用于 运行 的脚本中，我包含了 LD_LIBRARY_PATH，然后使用 Rscript 来 运行 R 脚本（调用 dyn.load("My_Fortran.so") , 使用 ifort 和 mkl 编译)。
然而，当我 运行 脚本时，它失败并显示 Intel MKL FATAL ERROR: Cannot load libmkl_avx.so or libmkl_def.so。 Rscript 是否有可能撤消我对 LD_LIBRARY_PATH 的设置？如果不是，是否可能因为这个版本的 R 不是用 intel parallel studio 编译的，所以它无法加载共享库？
我是这样 运行R 脚本并加载路径的：
#!/bin/bash
module load R/3.1.0
LD_LIBRARY_PATH=/path/to/intel_parallel_studio/xe_2015_u3/install/mkl/lib/intel64:$LD_LIBRARY_PATH
export LD_LIBRARY_PATH
Rscript myRscript.r
R 脚本失败：
Running R code
Attempting to load Fortran compiled shared library ... Done!
Calling Fortran subroutine from within R ...
MKL FATAL ERROR: Cannot load libmkl_avx.so or libmkl_def.so
您可以查看 R 和 Rscript 的 shell 脚本源代码。
一般来说，此类 PATH 设置（用于可执行文件和共享库）通常只会添加到，而不会被覆盖。所以你可能有另一个问题。
你可以编辑 /etc/ld.so.conf 吗？
编辑 还可以考虑在 module load R/3.1.0.
LD_LIBRARY_PATH