R - 系统图标签到向量

Question

如果我们使用 ape 包

从层次聚类中绘制系统发育图

phy <- hclust(dist(mtcars))
plot(as.phylo(phy),direction="downwards")

有没有办法按照它们在系统发育图中出现的顺序（从左到右阅读）将标签提取到向量中？

如果我尝试

phy$labels

我可以取出标签，但它们的顺序似乎不同。

Answer 1

使用额外的 order 组件，您可以按正确的顺序获得它们

with(phy, labels[order])
# [1] "Maserati Bora"       "Chrysler Imperial"   "Cadillac Fleetwood" 
#  [4] "Lincoln Continental" "Ford Pantera L"      "Duster 360"         
#  [7] "Camaro Z28"          "Hornet Sportabout"   "Pontiac Firebird"   
# [10] "Hornet 4 Drive"      "Valiant"             "Merc 450SLC"        
# ...

R - 系统图标签到向量

R - Phylogram labels to vector

r

hierarchical-clustering