pandas 数据框 - 减少初始值

pandas data frame - reduce with initial value

我要将我的一些 R 内容移至 Python,因此我必须使用 pandas.DataFrame。有几件事我想优化。

假设我们有一个 table

key value
abc 1
abc 2
abd 1

并且我们想要获得形式为 {key -> list[values]} 的字典。以下是我现在如何完成这项工作。

from pandas import DataFrame
from StringIO import StringIO


def get_dict(df):
    """
    :param df:
    :type df: DataFrame
    """
    def f(accum, row):
        """
        :param accum:
        :type accum: dict
        """
        key, value = row[1]
        return accum.setdefault(key, []).append(value) or accum
    return reduce(f, df.iterrows(), {})


table = StringIO("key\tvalue\nabc\t1\nabc\t2\nabd\t1")
parsed_table = [row.rstrip().split("\t") for row in table]
df = DataFrame(parsed_table[1:], columns=parsed_table[0])
result = get_dict(df)  # -> {'abc': ['1', '2'], 'abd': ['1']}

有两点我不喜欢它:

  1. 事实上,内置 reduce 使用标准 Python 迭代协议,这会降低 DataFrame 等基于 NumPy 的数据结构的速度。我知道 DataFrame.apply 有一个 reduce 模式,但它不像 dict 那样采用起始值。
  2. (一个小缺点) 我必须使用索引从行中获取特定值的事实。我希望我可以像 R 那样按名称连续访问特定字段,即 row$key 而不是 row[1][0]

提前致谢

您可以使用字典理解代替 get_dict

In [100]: {key:grp['value'].tolist() for key, grp in df.groupby('key')}
Out[100]: {'abc': ['1', '2'], 'abd': ['1']}

自动生成以列表作为值的字典意味着您将离开快速 NumPy 数组的领域并强制 Python 生成需要 Python 循环来迭代数据的对象。当数据集很大时,那些 Python 循环可能比等效的 NumPy/Pandas 函数调用慢得多。因此,如果您担心速度,您的最终目标可能并不理想。

如果您想利用 NumPy/Pandas 执行快速(呃)计算,您必须将数据保存在 NumPy 数组或 Pandas NDFrame 中。

一种选择是使用 groupby 并应用以 pandas 系列结束:

In [2]: df
Out[2]:
   key  value
0  abc      1
1  abc      2
2  abd      1

In [3]: df.groupby("key").value.apply(list)
Out[3]:
key
abc    [1, 2]
abd       [1]
Name: value, dtype: object

In [4]: _3.ix['abc']
Out[4]: [1, 2]