在 spark-shell 中使用 spark-csv 包读取 CSV

Question

我正在尝试使用 spark-csv 从 spark-shell 中的 aws s3 读取 csv。

以下是我执行的步骤。使用以下命令启动 spark-shell

bin/spark-shell --packages com.databricks:spark-csv_2.10:1.2.0

在shell中执行了以下scala代码

scala> val hadoopConf = sc.hadoopConfiguration
scala> hadoopConf.set("fs.s3.impl", "org.apache.hadoop.fs.s3native.NativeS3FileSystem")
scala> hadoopConf.set("fs.s3.awsAccessKeyId", "****")
scala> hadoopConf.set("fs.s3.awsSecretAccessKey", "****")

scala> val s3path = "s3n://bucket/sample.csv"
scala> val df = sqlContext.read.format("com.databricks.spark.csv").option("header", "true").load(s3path)

出现以下错误

java.io.IOException: No FileSystem for scheme: s3n
    at org.apache.hadoop.fs.FileSystem.getFileSystemClass(FileSystem.java:2584)
    at org.apache.hadoop.fs.FileSystem.createFileSystem(FileSystem.java:2591)
    at org.apache.hadoop.fs.FileSystem.access0(FileSystem.java:91)
    at org.apache.hadoop.fs.FileSystem$Cache.getInternal(FileSystem.java:2630)
    at org.apache.hadoop.fs.FileSystem$Cache.get(FileSystem.java:2612)
    at org.apache.hadoop.fs.FileSystem.get(FileSystem.java:370)
    at org.apache.hadoop.fs.Path.getFileSystem(Path.java:296)
    at org.apache.hadoop.mapred.FileInputFormat.singleThreadedListStatus(FileInputFormat.java:256)
    at org.apache.hadoop.mapred.FileInputFormat.listStatus(FileInputFormat.java:228)
    at org.apache.hadoop.mapred.FileInputFormat.getSplits(FileInputFormat.java:313)
    at org.apache.spark.rdd.HadoopRDD.getPartitions(HadoopRDD.scala:207)
    at org.apache.spark.rdd.RDD$$anonfun$partitions.apply(RDD.scala:219)
    at org.apache.spark.rdd.RDD$$anonfun$partitions.apply(RDD.scala:217)
    at scala.Option.getOrElse(Option.scala:120)

我在这里缺少什么？请注意，我可以使用

读取 csv

scala> sc.textFile(s3path)

相同的 Scala 代码在 databricks notebook 中也能正常工作

创建了 issue in spark-csv github. I'll update here when I get answer for the issue

Answer 1

对于 URL s3n://bucket/sample.csv，必须设置 s3n 的所有属性。因此，设置以下属性使我可以使用 spark-csv

读取 CSV

scala> val hadoopConf = sc.hadoopConfiguration
scala> hadoopConf.set("fs.s3n.impl", "org.apache.hadoop.fs.s3native.NativeS3FileSystem")
scala> hadoopConf.set("fs.s3n.awsAccessKeyId", "****")
scala> hadoopConf.set("fs.s3n.awsSecretAccessKey", "****")

参考https://github.com/databricks/spark-csv/issues/137

在 spark-shell 中使用 spark-csv 包读取 CSV

Reading CSV using spark-csv package in spark-shell

scala

apache-spark

spark-csv