运行 R 中的 glmnet 包，出现错误 "missing value where TRUE/FALSE needed"，可能是由于缺少值？

Question

我正在尝试使用 glmnet 包中的 glmnet 到运行 LASSO 回归。

我正在使用以下命令：

library(glmnet)
glmnet(a,b,family="binomial",alpha=1)

我收到错误：

> Error in if (!all(o)) { : missing value where TRUE/FALSE needed

a是一个矩阵，有数值。 b 是一个以因子作为值的向量。

但是，b 有一些缺失值。我怀疑这可能是导致错误的原因。但是，我在 glmnet 文档中没有看到排除 NAs 的选项。

Answer 1

由于 glmnet 不接受带有公式的完整数据框（因此不接受 na.omit），而是使用单独的响应矩阵和预测矩阵，因此您必须在 b 缺失，然后对预测矩阵进行子集化以排除这些行。

library(glmnet)

set.seed(123)
a <- matrix(rnorm(100*20),100,20)
b <- as.factor(sample(0:1,100,replace = TRUE))

b[10] <- NA

na_index <- is.na(b)
res <- glmnet(a[!na_index, ], b[!na_index], family = "binomial", alpha = 1)

运行 R 中的 glmnet 包，出现错误 "missing value where TRUE/FALSE needed"，可能是由于缺少值？

Running glmnet package in R, getting error "missing value where TRUE/FALSE needed", maybe due to missing values?

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glmnet