将 gunzip 输出重定向到 python 脚本

Question

我想要 gunzip 一系列文件，然后将输出重定向到我的 python 脚本。 python 脚本获取一个参数作为输入。我写了以下命令：

for i in $(ls test5/*/*gz); do gunzip -c $i | python script.py ; done

但它给我以下错误：

Traceback (most recent call last):
  File "./fqtofa.py", line 7, in <module>
    inFile = sys.argv[1]
IndexError: list index out of range

我想知道为什么它不能从 gunzip 输出中读取。

Answer 1

sys.argv 用于命令行参数。您没有传递任何这些，而是通过 stdin 将其通过管道输入。所以你需要阅读 sys.stdin.

Redirect gunzip output to python script