knitr/rmarkdown - 减小 html 文件大小

Question

我想使用 knitr/rmarkdown 生成一个 html 文档。目前，该文件超过 20MB，我正在尝试找到减少它的方法。文件太大可能是因为我的图里面有很多点。

如果我将输出类型更改为 pdf，我可以将其减小到 1.7MB。我想知道是否有一种方法可以减少我的文件，同时将其保留为 html.

编辑：这是我在 RStduio 中做的一个最小工作示例。

---
title: "Untitled"
author: "My Name"
date: "September 7, 2015"
output: html_document
---

```{r}
library(ggplot2)
knitr::opts_chunk$set(dev='svg')
```

```{r}
set.seed(1)
mydf <- data.frame(x=rnorm(2e4),y=rnorm(2e4))
ggplot(mydf, aes(x,y)) + geom_point(alpha=0.6)
```

我还注意到，如果我有太多的观察，则根本不会生成情节。我只是在输出中得到一个带有问号的空框。

```{r}
set.seed(2)
mydf <- data.frame(x=rnorm(5e4),y=rnorm(5e4))
ggplot(mydf, aes(x,y)) + geom_point(alpha=0.6)
# ...plot doesn't appear in output

```

Answer 1

根据@daroczig 使用 "dpi" knitr chunk 选项的建议，我修改了您的代码如下（见下文）。

您已将开发块选项设置为 "svg"，这会生成非常大的矢量图形文件，尤其是对于由许多元素（点、线等）组成的图像
我将开发块选项重新设置为 "png"，这是 HTML 输出的默认光栅图形格式。所以你根本不需要去碰它。保持 dev chunk 选项等于 "png" 会显着减少 HTML 输出文件的大小。
我将 dpi 块选项设置为 36（默认值为 72），以降低图像分辨率，并进一步减小 HTML 输出文件大小。
我将 out.width 和 out.height 块选项设置为“600px”，以增加图像尺寸。
您可以更改 dpi、out.width 和 out.height 选项，直到您获得所需的 HTML 输出文件大小和图像尺寸。输出文件大小和图像分辨率之间存在权衡。

编织代码后，我得到一个 HTML 输出文件大小等于 653kB，即使在绘制 5e4 个数据点时也是如此。

---
title: "Change size of output HTML file by reducing resolution of plot image"
author: "My Name"
date: "September 7, 2015"
output: html_document
---

```{r}
# load ggplot2 silently
suppressWarnings(library(ggplot2))
# chunk option dev="svg" produces very large vector graphics files
knitr::opts_chunk$set(dev="svg")
# chunk option dev="png" is the default raster graphics format for HTML output
knitr::opts_chunk$set(dev="png")
```

```{r, dpi=36, out.width="600px", out.height="600px"}
# chunk option dpi=72 is the default resolution
set.seed(1)
mydf <- data.frame(x=rnorm(5e4),y=rnorm(5e4))
ggplot(mydf, aes(x,y)) + geom_point(alpha=0.6)
```

Answer 2

为了防止带有许多点的散点图放大矢量图形（以及相应的 html 输出），您可以使用 ggrastr 包中的 geom_point_raster()。吃蛋糕也要吃！

knitr/rmarkdown - 减小 html 文件大小

knitr/rmarkdown - reducing html file size

html

resolution

rstudio

knitr

r-markdown