如何为 Rserve 提供 upstart 服务？

Question

我需要开始并保持运行来自 R 的 rserve。

我的 rserve.r 文件中有这些行：

library(Rserve)
Rserve()

所以，我正尝试在我的 upstart 脚本中做这样的事情：

description "Rserve service"
author      "Valter Silva"

start on filesystem or runlevel [2345]
stop on shutdown

respawn

script
    echo $$ > /var/run/rserve.pid
    exec /usr/bin/R /home/valter/R/rserve.R >> /home/valter/test2.log
end script


pre-start script
    echo "[`date`] Rserve Starting" >> /var/log/rserve.log
end script

pre-stop script
    rm /var/run/rserve.pid
    echo "[`date`] Rserve Stopping" >> /var/log/rserve.log
end script

我知道该服务运行是因为我的文件 test2.log 的输出。但它只运行一次。我应该怎么做才能保留它运行 ?

Answer 1

正如 Rserve 的 public 文档所说，您可以从 shell 脚本启动 Rserve 守护进程。

只需创建一个脚本来执行以下命令：

echo 'library(Rserve);Rserve(FALSE,args="--no-save --slave --RS-conf <your_own_path>/rserve.conf")'|<R_bin_path>/R --no-save --slave

例如，在我的 MacOS 计算机中，我可以启动 Rserve 执行以下行：

/bin/sh -c "echo 'library(Rserve);Rserve(FALSE,args=\"--slave\")'|/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/bin/exec/R --no-save --slave"

此命令输出如下内容：

Starting Rserve:
  /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/Rserve/libs//Rserve --slave 

Rserv started in daemon mode.

确保在启动 Rserve 时指定“--slave”参数。

您可以创建一个 shell 脚本（或 windows 脚本）并告诉 OS 在启动过程中执行此脚本。

Answer 2

你（和我）遇到这么多麻烦的原因是我们问错了问题。正确的问题是“我们如何从我们的客户端代码启动 Rserve？”Java（和大多数其他）客户端能够启动 Rserve。

java 库的问题答案在这里：

或此处用于 C# 库： https://github.com/SurajGupta/RserveCLI2/blob/master/RServeCLI2.Test/Rservice.cs

另一种方法是向 the best. The Rocker project copies supervisor.conf 学习至 /etc/supervisor/conf.d/ （参见 https://github.com/rocker-org/rocker/blob/master/rstudio/Dockerfile#L61）

您的 supervisor.conf 可以添加类似

的内容

[program:Rserve]
command=/usr/bin/Rserve.sh
stdout_logfile=/var/log/supervisor/%(program_name)s.log
stderr_logfile=/var/log/supervisor/%(program_name)s.log
user=myuser
startsecs=0
autorestart=false
exitcodes=0

但是... 我确实弄明白了。所以这就是答案。我很抱歉它有点笨拙和分散。对我来说，我最大的障碍是将我的 start/stop 脚本放在 /usr/bin 文件夹中（参见下面的讨论）

/etc/init/Rserve.conf

description "Rserve service"
author "Victor I. Wood"
version "0.01"

# based on
# 

env STARTSCRIPT=/usr/bin/Rserve.sh
env STOPSCRIPT=/usr/bin/Rserve.stop
env LOGFILE=/var/log/Rserve.log


start on runlevel [2345]
stop on runlevel [!2345]

console output

respawn

# tell upstart we're creating a daemon
# upstart manages PID creation for you.
expect fork


pre-start script
    echo "[`date`] Rserve Starting" >> $LOGFILE
    echo $$ > /var/run/Rserve.pid
end script

pre-stop script
    rm /var/run/Rserve.pid
    echo "[`date`] Rserve Stopping" >> $LOGFILE
    exec $STOPSCRIPT >> $LOGFILE
end script


script
        # My startup script, plain old shell scripting here.
        exec $STARTSCRIPT >> $LOGFILE
#       echo $$ > /var/run/rserve.pid
end script

/usr/bin/Rserve.sh

#!/bin/sh
sudo --login --set-home --user=myuser bash -c '~/Rserve.sh >~/Rserve.log 2>&1'

/usr/bin/Rserve.stop

#!/bin/sh
pkill -U myuser Rserve

/home/myuser/Rserve.sh

#!/bin/sh

# launch new Rserve process
R CMD Rserve --RS-conf /home/myuser/Rserve.conf --no-save >~/Rserve.log 2>&1

https://askubuntu.com/questions/62812/why-isnt-my-upstart-service-starting-on-system-boot?lq=1

我从脚本开始于 https://askubuntu.com/questions/62729/how-do-i-set-up-a-service?lq=1 并注意到 initctl 开始，这可能会在调试时派上用场。

https://askubuntu.com/questions/62812/why-isnt-my-upstart-service-starting-on-system-boot?lq=1 注意脚本必须在 /bin 中（但我使用 /usr/bin），并且必须由 root 拥有。有些人喜欢在其他地方的脚本中使用 link 作为脚本 i /bin

作为的人们建议，我正在使用我在 rServe 文档

中找到的 Rserve 启动命令

R CMD Rserve

虽然我已经扩展到

R CMD Rserve --RS-conf /home/myuser/Rserve.conf --no-save >~/Rserve.log 2>&1

我没有导出正确的 pid，所以我用 pkill 停止了它。更优雅的方法是

RSshutdown(rsc)

How can I shut down Rserve gracefully?

stdout 和 stderr 混淆了暴发户，所以用 2>&1 重新定向所有输出 How to redirect both stdout and stderr to a file

当我找到的时候我有点明白了 https://www.digitalocean.com/community/tutorials/the-upstart-event-system-what-it-is-and-how-to-use-it 和 https://geeknme.wordpress.com/2009/10/15/getting-started-with-upstart-in-ubuntu/ http://blog.joshsoftware.com/2012/02/14/upstart-scripts-in-ubuntu/ 但对于那些只想开始的人来说，这些是比官方文档更实用的起点。

更新

此解决方案采用 Upstart，这是最初的问题，但 Upstart 不再是默认服务管理器。如果您想在 post-16.04 系统上执行此操作，请使用

改回 Upstart

sudo apt-get install upstart-sysv
sudo update-initramfs -u
sudo apt-get purge systemd

（来自http://notesofaprogrammer.blogspot.com/2016/09/running-upstart-on-ubuntu-1604-lts.html）

如何为 Rserve 提供 upstart 服务？

How to make an upstart service to Rserve?

r

rserve

更新