连接两个大 RDD 时映射阶段的溢出问题

Question

我尝试对来自两个大文本文件的两个数据集应用 join。两个文本文件都包含如下两列：

*col1*     *document*
abc            1
aab            1
...           ...
ccd            2
abc            2
...           ...

我根据这两个文件的第一列加入这两个文件，并尝试找出文档有多少共同的 col1 值。两个文本文件的大小均为 10 GB。当我运行我的脚本 spark 创建了 6 个阶段，每个阶段有 287 个分区。在这 6 个阶段中，有 4 个不同，一个用于每个阶段，一个用于地图。一切顺利，直到第 5 阶段的映射阶段。在那个阶段，spark 停止处理分区，而是溢出到磁盘上，在溢出一万次之后，它给出了一个与磁盘不足相关的错误 space。

我有 4 个内核和 8 GB 内存。我用-Xmx8g 给了所有内存。我也试过 set("spark.shuffle.spill", "true").

My script:

{
...
val conf = new SparkConf().setAppName("ngram_app").setMaster("local[4]").set("spark.shuffle.spill", "false")
    val sc = new SparkContext(conf)


val emp = sc.textFile("...doc1.txt").map { line => val parts = line.split("\t")
     ((parts(5)),parts(0))
    }

    val emp_new = sc.textFile("...doc2.txt").map { line => val parts = line.split("\t")
      ((parts(3)),parts(1))
    }


val finalemp = emp_new.join(emp).
        map { case((nk1) ,((parts1), (val1))) => (parts1 + "-" + val1, 1)}.reduceByKey((a, b) => a + b)

    finalemp.foreach(println)

}

我应该怎么做才能避免溢出这么多？

Answer 1

您似乎需要更改 Spark 的内存设置。如果您使用 spark-submit 脚本，您只需将 -executor-memory 8G 添加到您的命令中。设置 -Xmx8g 会影响 JVM，但不会影响 Spark（我认为默认为 256MB）。

请注意，根据经验法则，您不应为 Spark 作业分配超过 75% 的可用内存。

连接两个大 RDD 时映射阶段的溢出问题

Spilling issue on mapping stage when joining two big RDDs

scala

apache-spark

diskspace