Linux 中的 runjags 摘要
runjags summaries in Linux
我在函数run.jags中设置了summarise = TRUE，然后将输出对象保存为save(out, file="out.RData")。
当我稍后加载此对象时，我可以检索摘要、图表等。
但是，当我使用完全相同的代码和 运行 模型，并将输出保存在 Linux 集群上，然后在 Windows 中加载对象以使用它, 摘要和图不可用。当我键入 summary(out)、print(out)、plot(out) 或 add.summaries(out) 时，我收到以下错误消息：
Error: Invalid runjags.object provided; the output of a runjags function (with class 'runjags') must be supplied
尽管 class(out) returns "runjags".
事实上，names(out) 显示摘要（以及许多其他内容）未包含在输出中。帮助文件确实表明默认包含 summaries/plots 等。
在 Linux 中 运行 模型是否存在以下问题：1) 阻止生成摘要，或 2) 弄乱了输出对象的 class？
我当然可以使用 coda 包并执行 out2 <- as.mcmc.list(out)，然后我可以使用 coda 函数来处理输出。
问题不是 Linux（请参阅 Matt Denwood 的评论），而是 runjags 的旧版本。我在 Linux 机器上更新了 runjags（好吧，我让系统管理员来做），这解决了问题。
我在函数run.jags中设置了summarise = TRUE，然后将输出对象保存为save(out, file="out.RData")。
当我稍后加载此对象时，我可以检索摘要、图表等。
但是，当我使用完全相同的代码和 运行 模型，并将输出保存在 Linux 集群上，然后在 Windows 中加载对象以使用它, 摘要和图不可用。当我键入 summary(out)、print(out)、plot(out) 或 add.summaries(out) 时，我收到以下错误消息：
Error: Invalid runjags.object provided; the output of a runjags function (with class 'runjags') must be supplied
尽管 class(out) returns "runjags".
事实上，names(out) 显示摘要（以及许多其他内容）未包含在输出中。帮助文件确实表明默认包含 summaries/plots 等。
在 Linux 中 运行 模型是否存在以下问题：1) 阻止生成摘要，或 2) 弄乱了输出对象的 class？
我当然可以使用 coda 包并执行 out2 <- as.mcmc.list(out)，然后我可以使用 coda 函数来处理输出。
问题不是 Linux（请参阅 Matt Denwood 的评论），而是 runjags 的旧版本。我在 Linux 机器上更新了 runjags（好吧，我让系统管理员来做），这解决了问题。