如何在 R 包构建中压缩保存

Question

我试图在 R 包中包含一个（有点）大的数据集。我在 Rstudio 检查期间不断收到警告，说我可以通过压缩保存 space：

* checking data for ASCII and uncompressed saves ... WARNING

  Note: significantly better compression could be obtained
        by using R CMD build --resave-data
          old_size new_size compress
  slp.rda    499Kb    310Kb    bzip2
  sst.rda    1.3Mb    977Kb       xz

我试过将 -- resave-data 添加到 RStudio 的 "Configure Buid Tools" 但没有效果。

Answer 1

devtools 函数 use_data 接受压缩类型的参数，通常可以更轻松地将数据添加到 pkgs。使用它，或仅 save 自己使用），在保存数据时使用 xz 压缩（对于 save 它是 compression_level 参数）。

如果你想使用 --resave-data 那么你可以尝试 --resave-data=best 因为只使用 --resave-data 默认为 gzip （在这种情况下你几乎什么也得不到）。

有关详细信息，请参阅 Building package tarballs。

Answer 2

如果您有一个不想重新创建的大型数据集，另一种选择是在 R 中使用 tools::resaveRdaFiles。将其指向数据集文件或整个数据目录，它将以您选择的格式压缩您的数据。有关详细信息，请参阅其 manual page。