使用来自 python 的可变参数调用 linux 命令

Question

我正在尝试从 python2x.

执行一个程序

在终端中，作业将运行为：

mpirun -np 8 ~/WORK/scf Fe_SCF.inp > Fe_SCF.out

其中Fe_SCF.*是输入输出在CWD.

现在，我正在尝试从 python 脚本中运行这篇文章。因为，我已将它们定义为变量并尝试调用为：

call(["mpirun -np 8 ~/WORK/scf", scfin,  scfout])

给出错误：

  File "./triolith.py", line 38, in <module>
        call(["mpirun -np 8 ~/WORK/scf", scfin,  scfout])
      File "/usr/lib64/python2.7/subprocess.py", line 522, in call
        return Popen(*popenargs, **kwargs).wait()
      File "/usr/lib64/python2.7/subprocess.py", line 710, in __init__
        errread, errwrite)
      File "/usr/lib64/python2.7/subprocess.py", line 1335, in _execute_child
        raise child_exception
    OSError: [Errno 2] No such file or directory

使用真实的文件名也不能解决问题：

 call(["mpirun -np 8 ~/WORK/scf", "Fe_SCF.inp",  "Fe_SCF.out"])

给出错误：

File "./triolith.py", line 38, in <module>
    call(["mpirun -np 8 ~/WORK/scf", "Fe_SCF.inp",  "Fe_SCF.out"])
  File "/usr/lib64/python2.7/subprocess.py", line 522, in call
    return Popen(*popenargs, **kwargs).wait()
  File "/usr/lib64/python2.7/subprocess.py", line 710, in __init__
    errread, errwrite)
  File "/usr/lib64/python2.7/subprocess.py", line 1335, in _execute_child
    raise child_exception
OSError: [Errno 2] No such file or directory

我已经检查并可以确认，使用 os.system 正在使用 "Real" 文件名，但不适用于变量名：

 os.system("mpirun -np 8 ~/WORK/scf scfin" )

那么，使用这两种方法中的任何一种，我怎样才能用变量名作为输入和输出来调用程序？

Answer 1

在后一个使用 OS 模块的示例中，您应该能够做到：

os.system("mpirun -np 8 ~/WORK/scf "+ var_name)

给运行你的函数调用。

对于多个变量，d o:

os.system("mpirun -np 8 ~WORK/scf " + var_1 + " " + var_2)

Answer 2

调用需要一个列表，因此您的第一个示例应该是：

cmd = ['/absolute/path/to/mpirun', '-np', '8', '~WORK/scf', var_1]
call(cmd, stdout=var_2, stderr=STDOUT)

使用来自 python 的可变参数调用 linux 命令

call linux command with variable argument from python

python

command-line

command