python 悲伤的酸洗问题

Question

import pathos.multiprocessing as mp
class Model_Output_File():
    """
    Class to read Model Output files
    """
    def __init__(self, ftype = ''):
        """
        Constructor
        """
        # Create a sqlite database in the analysis directory
        self.db_name = 'sqlite:///' + constants.anly_dir + os.sep + ftype + '_' + '.db'
        self.engine  = create_engine(self.db_name)
        self.ftype   = ftype

    def parse_DGN(self, fl):
        df      = pandas.read_csv(...)
        df.to_sql(self.db_name, self.engine, if_exists='append')

    def collect_epic_output(self, fls):
        pool = mp.ProcessingPool(4)
        if(self.ftype == 'DGN'):
            pool.map(self.parse_DGN, fls)
        else:
            logging.info( 'Wrong file type')

if __name__ == '__main__':
    list_fls = fnmatch.filter(...)
    obj = Model_Output_File(ftype = 'DGN')
    obj.collect_model_output(list_fls)

在上面的代码中，我使用 pathos 多处理库来避免 python 与类的多处理问题。但是我收到一个酸洗错误：

  pool.map(self.parse_DGN, fls)
  File "C:\Anaconda64\lib\site-packages\pathos-0.2a1.dev0-py2.7.egg\pathos\multiprocessing.py", line 131, in map
    return _pool.map(star(f), zip(*args)) # chunksize
  File "C:\Anaconda64\lib\multiprocessing\pool.py", line 251, in map
    return self.map_async(func, iterable, chunksize).get()
  File "C:\Anaconda64\lib\multiprocessing\pool.py", line 567, in get
    raise self._value
cPickle.PicklingError: Can't pickle <type 'function'>: attribute lookup __builtin__.function failed

我该如何解决这个问题？

Answer 1

我是 pathos 的作者。你得到一个 cPickle.PicklingError… 你不应该用 pathos 得到它。确保你已经安装了 multiprocess，如果你安装了，那么你有一个 C++ 编译器。您可以通过导入 dill 并在 class 中执行 dill.copy(self.parse_DGN) 或在外部使用 class 的实例来检查 pickling 错误。如果可行，那么您可能遇到了一些安装问题，其中 pathos 正在寻找 python 标准库 multiprocessing。如果是这样，那么您可能需要安装一个编译器……例如 Microsoft Visual Studio Community。参见：github.com/mmckerns/tuthpc。确保在安装 MS 编译器后重建 multiprocess。

Answer 2

我遇到了同样的问题。神秘的是相同的相同代码在一台 win7 机器上工作而不是另一台 win7！然后我检查了版本——原来 dill 和 multiprocess 在 balky 机器上的版本高了 1。我 down-versioned dill 和 multiprocess 分别为 0.2.5 和 0.70.4。这解决了问题！希望有帮助

python 悲伤的酸洗问题

Pickling issue with python pathos

python

python-multiprocessing

pathos