NetworkX中如何定位巨型组件的中心节点?

How to locate the center node of a giant component in NetworkX?

我正在使用具有二维网格形状的常规网络。它由 NxN=100x100=10000 个节点组成。它有一个坐标系,node 0在左上角,(0,0)位置,node 10000在右下角,(100,100)位置。

网络是这样创建的:

N=100 #The number of nodes per side
G=nx.grid_2d_graph(N,N)
pos = dict( (n, n) for n in G.nodes() ) #Dictionary of all positions
labels = dict( ((i, j), i + (N-1-j) * N ) for i, j in G.nodes() )
nx.set_node_attributes(G, 'pos', pos) #Store pos attributes in the nodes
nx.set_node_attributes(G, 'labels', labels) #Store labels attributes in the nodes
nx.draw_networkx(G, pos=nx.get_node_attributes(G, 'pos'),
                 labels=nx.get_node_attributes(G, 'labels'),
                 with_labels=False, node_size=10)

该网络由于对大量负载的响应而变得支离破碎。这些是许多 csv 个文件,这些文件的值用作节点的输入。失败后网络是这样的(这是单次加载文件的结果):

我的问题:如何确定巨型组件[=41]的中心节点的位置=],并确定它与左上角的距离,例如坐标为(0,0)?

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由于响应的可变性,很少有节点位于 (0,0) 位置,因此使用 nx.shortest_path() 将毫无意义,因为该节点大部分时间都会丢失。因此,我想测量网络的一个点(巨型组件的中心)与同一“区域”的另一个点之间的距离,该点可能不属于网络。所以,函数nx.shortest_path()不能使用,否则当路径不存在时会抛出error

  • 首先使用以下方法检索图形的巨大组成部分:(referenced here)

    giant = max(nx.connected_component_subgraphs(G), key=len)

  • 检索中心节点:

    center_nodes = center(giant)

  • 节点的位置就是中心节点本身,因为键就是位置。所以要显示中心节点的位置,例如:

    print center_nodes

  • 要确定从中心节点之一的节点到 (i,j) 坐标的距离,您必须保留一份包含所有 100x100 节点的原始图的副本。我将在这里使用它作为 org_G

    # i,j can represent any coordinate in the 100x100 grid (0,0) for instance
    n = (i,j) 
    print nx.shortest_path(org_G,n,center_nodes[0])