嵌入式neo4j:迭代一个巨大图的所有节点

embedded neo4j: iterate over all nodes of a huge graph

我想遍历 ~100Mio 图中的所有节点。我知道我可以通过密码查询获取节点

    MATCH n RETURN n

但是我必须使用 LIMIT 和 SKIP 来处理数据集,我认为这种方法存在性能问题。

现在我的问题是:如何使用嵌入式 neo4j 数据库遍历所有节点?整个事情将是一个后台工作(将节点索引到 elasticsearch)。

既然你提到你正在使用嵌入式 Neo4j,你可能想使用 Java API 记录 here 而不是 Cypher。

具体来说,class GlobalGraphOperations 提供了一个 getAllNodes() 方法,如记录 here:

for (Node node : GlobalGraphOperations.at(db).getAllNodes()) {
  // Do something with the node here
}

编辑

需要考虑的其他几点:

  1. 您可以实现 transaction hook handler 以在节点 inserted/updated 时启动 Elasticsearch 索引操作,而不是遍历数据库中的所有节点。
  2. 如果您希望此操作在后台定期 运行,您可能需要考虑使用 GraphAware framework's timer driven runtime module。此插件提供 运行 时间在后台定期执行操作,并且可以配置为随着数据库负载的增加而缩减。

感谢大家提到 GraphAware,只是为了混合使用另一种方法:使用 vanilla GlobalGraphOperations 获取所有节点的问题在于它全部发生在单个事务中。在具有 100M 个节点的图表上,这将不起作用。

出于这个原因,GraphAware Framework has a number of BatchTransactionExecutor我们在我们的模块中使用重新索引/恢复以及您需要为每个节点/关系或其中的一个子集做一些事情的场景。

让我 post 举例说明如何使用它 - 它来自 GraphAware 的模式执行模块(不是开源的,因此 post 在这里):

    final List<String> violations = new LinkedList<>();

    new IterableInputBatchTransactionExecutor<>(database, 1000, 
            new AllNodes(database, 1000),
            new UnitOfWork<Node>() {
                @Override
                public void execute(GraphDatabaseService database, Node input, int batchNumber, int stepNumber) {
                    for (Constraint<Node> constraint : nodeConstraints) {
                        if (!constraint.satisfiedBy(input)) {
                            violations.add(input + " violates " + constraint.toString());
                        }
                    }
                }
            }).execute();

大多数输入参数应该是不言自明的。请注意,AllNodes 是另一个框架 class,它从 database 中以每个事务 1000 个(在本例中)的批次获取所有节点。我们提供其他(AllNodesWithLabelAllRelationships),但您可以轻松实现自己的。

在后台执行此操作就是创建一个单独的线程,或者如果您想变得更复杂,请使用 William 已经指出的框架的定时器驱动模块。