绘制来自多列但一行的值

Question

我有单行数据和多个 columns.I 想 在单个图中绘制每一列的数据 。我有 100 列，例如 this.What 将是在 R 中执行此操作的最佳方式。

matplot(df[1,],type="o")

我已经为以下数据尝试了各种选项，例如上面的选项：

  gene  Sample_23770_A54T_RNAX  Sample_27931_RNAX   Sample_28891_RNAX   Sample_28897_RNAX Sample_28977_RNAX Sample_28979_RNAX   Sample_PM100_Z1_1_RNA   Sample_PM117_Z10_1_Case_RNASeq Sample_PM117_Z1_1_Case_RNASeq
  CD274 5.9315  1.9569  10.3786 5.2705  5.7112  1.814   0.3493  0.6846  1.0373

此外，我可以对多列使用 ggplot 函数吗？基本上，我想绘制比较 100 个不同列的单行的表达式值。

Answer 1

使用 ggplot2:

library(ggplot2)
cd274 <- read.table(text = "gene  Sample_23770_A54T_RNAX  Sample_27931_RNAX   Sample_28891_RNAX   Sample_28897_RNAX Sample_28977_RNAX Sample_28979_RNAX   Sample_PM100_Z1_1_RNA   Sample_PM117_Z10_1_Case_RNASeq Sample_PM117_Z1_1_Case_RNASeq
CD274 5.9315  1.9569  10.3786 5.2705  5.7112  1.814   0.3493  0.6846  1.0373", header = T)
cd274 <- melt(cd274[, 2:ncol(cd274)])
ggplot(cd274, aes(x = variable, y = value)) + geom_bar(stat = "identity") + coord_flip()

绘制来自多列但一行的值

Plotting values from multiple columns but for one row

plot

r

ggplot2

dataframe