Sklearn:评估 GridSearchCV 中 OneVsRestClassifier 的每个分类器的性能

Sklearn: Evaluate performance of each classifier of OneVsRestClassifier inside GridSearchCV

我正在使用 OneVsRestClassifierSVC

处理多标签分类
from sklearn.datasets import make_multilabel_classification
from sklearn.multiclass import OneVsRestClassifier
from sklearn.svm import SVC
from sklearn.grid_search import GridSearchCV

L=3
X, y = make_multilabel_classification(n_classes=L, n_labels=2,
                                  allow_unlabeled=True,
                                  random_state=1, return_indicator=True)    
model_to_set = OneVsRestClassifier(SVC())

parameters = {
    "estimator__C": [1,2,4,8],
    "estimator__kernel": ["poly","rbf"],
    "estimator__degree":[1, 2, 3, 4],
}

model_tunning = GridSearchCV(model_to_set, param_grid=parameters,
                             scoring='f1')

model_tunning.fit(X, y)

print model_tunning.best_score_
print model_tunning.best_params_

#0.855175822314
#{'estimator__kernel': 'poly', 'estimator__C': 1, 'estimator__degree': 3}

第一个问题

数字0.85代表什么?它是 L 个分类器中最好的分数还是平均分?同样,参数集是否代表 L 个分类器中的最佳得分者?

第二题

如果我是对的,OneVsRestClassifier 确实为每个标签构建了 L 个分类器,因此可以期望访问或观察每个标签的性能。但是,在上面的示例中,如何从 GridSearchCV 对象中获取 L 分数?

编辑

为了简化问题并帮助自己更多地了解 OneVsRestClassifier,在调整模型之前,

model_to_set.fit(X,y)
gp = model_to_set.predict(X) # the "global" prediction
fp = model_to_set.estimators_[0].predict(X) # the first-class prediction
sp = model_to_set.estimators_[1].predict(X) # the second-class prediction
tp = model_to_set.estimators_[2].predict(X) # the third-class prediction

可以显示gp.T[0]==fpgp.T[1]==spgp.T[2]==tp。所以 "global" 预测只是 'sequential' L 个人预测, 第二个问题已解决 .

但我仍然感到困惑,如果一个元分类器 OneVsRestClassifier 包含 L 个分类器,那么 GridSearchCV returns 怎么可能只有一个最好的分数,对应于对于具有 L 个分类器的元分类器 OneVsRestClassifier 的 4*2*4 组参数之一?

如有任何评论,我们将不胜感激。

GridSearchCV 根据您的参数值创建网格,它将您的 OneVsRestClassifier 评估为原子 classifier(即 GridSearchCV 不知道这个 metaclass生成器)

首先:0.85是OneVsRestClassifier参数[=16的所有可能组合(你的情况是16种组合,4*2*4)中最好的分数=],这意味着 GridSearchCV 评估 16(同样,仅在这种特殊情况下)可能 OneVsRestClassifier,其中每个包含 L SVC。一个 OneVsRestClassifier 中的所有 L class 化器都具有相同的参数值(但他们每个人都在学习从 L 可能中识别自己的 class)

即来自一组

{OneVsRestClassifier(SVC(C=1, kernel="poly", degree=1)),
 OneVsRestClassifier(SVC(C=1, kernel="poly", degree=2)),
 ...,
 OneVsRestClassifier(SVC(C=8, kernel="rbf", degree=3)),
 OneVsRestClassifier(SVC(C=8, kernel="rbf", degree=4))}

它选择得分最高的一个。

这里的

model_tunning.best_params_表示OneVsRestClassifier(SVC())的参数,它将实现model_tunning.best_score_。 您可以从 model_tunning.best_estimator_ 属性中获得最好的 OneVsRestClassifier

其次: 没有现成的代码可以从 OneVsRestClassifier 获得 L classifiers 的单独分数,但您可以查看实现OneVsRestClassifier.fit 方法,或采用此方法(应该有效 :)):

# Here X, y - your dataset
one_vs_rest = model_tunning.best_estimator_
yT = one_vs_rest.label_binarizer_.transform(y).toarray().T
# Iterate through all L classifiers
for classifier, is_ith_class in zip(one_vs_rest.estimators_, yT):
    print(classifier.score(X, is_ith_class))

受@Olologin 的回答启发,我意识到 0.85 是通过 L 预测获得的 f1 分数(在此示例中)的最佳加权平均值。在下面的代码中,我通过内部测试评估模型,使用 f1 分数的宏观平均值:

# Case A, inspect F1 score using the meta-classifier
F_A = f1_score(y, model_tunning.best_estimator_.predict(X), average='macro')

# Case B, inspect F1 scores of each label (binary task) and collect them by macro average
F_B = []
for label, clc in zip(y.T, model_tunning.best_estimator_.estimators_):
    F_B.append(f1_score(label, clf.predict(X)))
F_B = mean(F_B)

F_A==F_B # True

因此,这意味着 GridSearchCV 应用 4*2*4 组参数中的一组来构建元分类器,后者又使用 L 分类器之一对每个标签进行预测.结果将是 L f1 scores for L labels,每个标签都是二元任务的表现。最后,对L f1 scores.

取平均(宏观或加权平均,由f1_score中的参数指定)得到单个分数。

然后GridSearchCV在4*2*4组参数中选择最好的平均f1分数,在这个例子中是0.85。

虽然使用包装器解决多标签问题很方便,但它只能使用用于构建 L 分类器的同一组参数最大化平均 f1 分数。如果想分别优化每个标签的性能,似乎必须在不使用包装器的情况下构建 L 个分类器。

关于你的第二个问题,你可能想将 GridSearchCVscikit-multilearn's BinaryRelevance classifier. Like OneVsRestClassifier, Binary Relevance creates L single-label classifiers, one per label. For each label the training data is 1 if label is present and 0 if not present. The best selected classifier set is the BinaryRelevance class instance in best_estimator_ property of GridSearchCV. Use for predicting floats of probabilities use the predict_proba method of the BinaryRelevance object. An example can be found in the scikit-multilearn docs for model selection 一起使用。

在你的情况下,我会 运行 以下代码:

from skmultilearn.problem_transform import BinaryRelevance
from sklearn.model_selection import GridSearchCV
import sklearn.metrics

model_to_set = BinaryRelevance(SVC())

parameters = {
    "classifier__estimator__C": [1,2,4,8],
    "classifier__estimator__kernel": ["poly","rbf"],
    "classifier__estimator__degree":[1, 2, 3, 4],
}

model_tunning = GridSearchCV(model_to_set, param_grid=parameters,
                             scoring='f1')

model_tunning.fit(X, y)

# for some X_test testing set
predictions = model_tunning.best_estimator_.predict(X_test)

# average=None gives per label score
metrics.f1_score(y_test, predictions, average = None) 

请注意,multi-label 分类的方法比二元相关性好得多 :) 您可以在 madjarov's comparison or my recent paper.

中找到它们